Bei einem Ender 3 habe ich das nicht gemacht, aber der Weg sollte ähnlich sein. Du hast also eine fertig modifizierte Firmware für deinen Drucker geladen und geflasht. Das BL-Touch hast du wie am Drucker befestigt? Ist das nach der Anleitung zu der modifizierten Firmware oder hast du selber die nötigen Änderungen in der Firmware vorgenommen? (Offsets auf X und Y zur Düse)
Im Menü müssten auch ein paar Punkte für das BL-Touch dazu gekommen sein. Unter anderem kannst du da prüfen, ob das BL-Touch korrekt angesteuert wird (deploy Probe). Wenn das alles funktioniert, dann musst du als nächstes den Z-Offset einstellen. Also wenn das BL-Touch auslöst, dann soll der Drucker daraus Z=0 mm machen. Die Düse ist dann aber wahrscheinlich nicht auf der richtigen Höhe zum Drucken. Und diese Differenz musst du noch ermitteln und am Drucker einstellen (+speichern). Ich weiß nicht, ob die Firmware dafür einen "Wizard" hat, der dich da an die Hand nimmt oder ob du das alles im Alleingang machen musst.
Bei mir war das so, dass ich den Druckkopf über das Druckbett fahren musste und dann Z homen musste (also Z auf 0). Dann habe ich ein Blatt Papier zwischen Düse und Druckbett gelegt und manuell über das Menü in kleinen Schritten Z soweit abgesenkt bis die Düse am Papier angekommen war, dieses aber noch nicht eingeklemmt hat. Den Wert, den ich nun also auf Z ablesen konnte, habe ich als Offset gespeichert.
Und fast vergessen... Im Slicer (Cura) musst du auch noch Änderungen vornehmen. Da gibt es aber sicher ein geändertes Profil für, wo die Einstellungen schon drin sind.